THE BIOCHEMISTATION
15 Mart 2016 Salı
10 Mart 2016 Perşembe
1 Şubat 2016 Pazartesi
YEŞİLAY İLE İŞBİRLİĞİ
Yaptığımız ziyaretlerden ve sergi sırasında bizi ziyaret eden Bünyemin Bey(İzmir Şubesi Başkanı) ile anı fotoğraflarımız..
5 Ocak 2016 Salı
HALOPERİDOL İLE HEDEFLENMİŞ LİPOZOM SENTEZİ
Lipozomumuzu sentezlerken iki farklı tür lipid kullandık:
1,2-dimyristoyl-sn-glycero-3-phosphocholine (DMPC) |
Phosphatidylethanolamine (PE) |
Hedefleme: HALOPERİDOL LİGANDINI İÇEREN LİPİDİN HAZIRLANMASI
Haloperidolün -OH grupları lipidin (PE) amino grupları (NH3) ile bağlandı. Bu işlem de
1,1'-Carbonyldiimidazole (CDI) çapraz bağlayıcı reaksiyonuyla yapıldı.
Haloperidol ile CDI 2 saat bekletilerek haloperidolün hidroksil (-OH) grupları minishaker'da
(37 ºC, 1000 rpm) aktive edildi.
2 saat bekleme süresince haloperidolümüze bağlanacak olan PE lipid porsiyonlandı. Bu işlem yapılırken 10 mg/mL'lık lipid stoğuna yeterli miktarda kloroform eklenerek istenilen stok konsantrasyonu sağlandı daha sonra 1,0 mg/mL'lik porsiyonlara bölündü. Kloroformun uçmaması ve lipidlerin bozulmaması için çalışmalar buzda yapıldı.
CDI ile aktivasyon süresinin sonunda (2 saat) uygun miktarda lipid eklenerek Borat tamponunda (pH: 8,5) 750 rpm, 24ºC'de gece boyu reaksiyona bırakıldı.
CDI |
Yeterli miktarda CDI tartılırken |
CDI ve Haloperidol'ün Vorteks yardımıyla karıştırılması |
Lipidlerin porsiyonlanması |
CDI ve Haloperidol'ün uygun koşullarda 2 saat boyunca minishakerda bırakılması |
Oluşturulan ligandın uygun koşullarda gece boyu minishaker'da bırakılması |
LİPOZOM SENTEZİ
Lipozomlar geleneksel
ince film hidrasyon yöntemiyle hazırlanmıştır. Lipozomların hazırlanmasında DMPC
: PE : Chol kullanıldı. 3:1 (v/v) oranında kloroform : metanol karışımında
hazırlanan lipid çözeltisi 50 mL lik yuvarlak dipli balona konuldu ve rotary
evaporatörde 40 oC de organik çözgenler buharlaştırılarak lipid film
tabakası oluşturuldu. Ardından pH’sı 7,4’e ayarlı tuzlu fosfat tamponu
(phosphate buffer saline, PBS) film tabakasının üzerine eklendi ve balon
hızlıca vortekslendi. Lipid film tabakasının katmanlar halinde kalkmasıyla çok
tabakalı lipozom vezikülleri oluşur. Hidrasyon aşaması 40 oC’de 2
saat boyunca hafif çalkalama ile gerçekleştirildi. 2 saatin sonunda veziküller Hamilton şırıngalarına alınarak ekstrüzyon
işlemine başlandı. Ekstrüzyon işlemi 80 nm por çaplı polikarbonat membranlar
kullanılarak, 11 kez örneğin membrandan geçirilmesiyle gerçekleştirildi. Elde
edilen lipozom örnekleri sonraki aşamalarda kullanılmak üzere +4oC’de
depolandı.
Enkapsüle etmek istediğimiz materyal, hidrofilik karakterde ise lipozom sentezi sırasında hidrasyon aşamasında eklenir. Eğer hidrofobik karakterde ise film tabakası oluşturulmadan önce lipitlerle birlikte eklenir. Böylece hidrofobik maddeler, lipozomun membranında yer alırken; hidrofilik maddeler ise vezikülün içinde yer alır.
Yukarıda anlatılan işlemler, herhangi bir madde enkapsüle edilmemiş ve yüzeyine bağlanmış bir grup içermeyen lipozomlar için izlenen temel adımlardır. Biz çalışmamızda sentezlediğimiz lipozomlara sigma1 reseptörlerini tanıyıcı özellik kazandırmak için hedefleme ajanı olarak haloperidol bağladık. Lipozomların yapısında haloperidolün yer alması için sentez öncesinde lipide (PE) haloperidolü bağladık ve daha sonra yukarıdaki sentez metoduna göre lipozom hazırladık. Böylece dış kısımda haloperidol içeren lipozom veziküllerini elde etmiş olduk.
KARAKTERİZASYON
BOYUT ANALİZİ:
İlk olarak hazırlanan veziküllerin parçacık boyut
analizi ve yüzey zeta potansiyelleri* taze örneklerle bakıldı. Bu amaçla Dynamic light scattering (DLS) (Partikül boyutu ölçüm cihazı) kullanıldı. Bunun için + 4 oC
de tutulan örneklerden 50 µL alınarak saf su ile 1,0 mL ye tamamlandı ve üç tekrarlı
ölçümler alındı.
*Zeta Potansiyel: Yüzey yükü
Örneği cihaza yerleştirmek üzere seyreltirken |
DLS cihazını çalıştırırken |
DLS cihazı |
Ölçümler sonucunda elde edilen partikül boyutu ve zeta potansiyel değerleri boş lipozom ve haloperidol ile hedeflenmiş lipozom için aşağıdaki gibidir;
Boyut (nm)
|
Zeta Potansiyel (mV)
|
|
Boş lipozom
|
108±37,08
|
-13,2±6,16
|
Haloperidol ile hedeflenmiş Lipozom
|
99±32,30
|
-31±5,32
|
2 Aralık 2015 Çarşamba
PBS TAMPONU HAZIRLAMA
PBS (Phosphate buffered saline) tamponu biyolojik uygulamalarda canlı organizmadaki pH koşullarını sağladığı için kullanılmaktadır. In vitro hücre kültürü çalışmalarında hücrelere uygulanacak örnekler PBS tamponunda hazırlanır.
Tampon hazırlamak için aşağıdaki maddeler belirtilen miktarlarda tartılarak bir beherin içine alındı.
Malzemeler:
NaCl - 8,0 g/L
KCl - 0,2 g/L
Na2HPO4 - 1,44 g/L
KH2PO4 -0,24 g/L
500 mL tampon hazırlamak için beherin üzerine yaklaşık 490 mL distile su eklendi. Daha sonra manyetik karştırıcada çözününceye kadar karıştırıldı. Çözündükten sonra beherdeki çözelti 500 mL'ye tamamlandı. Daha sonra uygun bir şişeye alınarak denemelerde kullanmak üzere +4ºC buzdolabında saklandı.
Gerekli kimyasalların uygun miktarlarda hassas teraziyle tartılması |
Manyetik karıştırıcıyla çözünürken |
Karıştırma hızının ayarlanması (600 rpm) |
Beherdeki tampon çözeltisinin balonjojeye aktarılması |
Tampon çözeltimiz |
9 Eylül 2015 Çarşamba
HÜCRE KÜLTÜRÜ LABORATUVARINDA BİR GÜN-2: PASAJ İŞLEMİ
Pasaj: Flaskı %70 oranında kaplamış olan hücre kültürünün taze bir besi yeri ortamına aktarma işlemidir.
Bugün pasaj işleminde öncelikle dolaptan çıkarılan malzemeler oda sıcaklığına getirilmek amacıyla sıcak su banyosuna tabi tutuldu. Biyolojik güvenlik kabinine herhangi bir madde sokmadan önce her şey alkolle sterilize edildi. Biyolojik güvenlik kabini içerisinde besi yeri flask üzerine yapışarak büyüyen hücrelerden uzaklaştırıldı. Flasktaki besiyeri kalıntılarını uzaklaştırmak amaçlı hücre kültürü PBS (phosphate buffered saline) tamponu ile yıkandı ve işlem sonrası sıvı flasktan uzaklaştırıldı. Hücreleri yüzeyden kaldırmak için yüzeye tutunmalarını sağlayan proteinleri (integrin gibi) yıkıma uğratan tripsin enzimi ile muamele edildi. Tripsin enzimi 37 ºC'de aktif olduğundan hücre tipine göre flask inkübatörde 2-15 dk. bekletilmelidir. Böylece hücreler yüzeyden ayrılmış oldu. Bekleme sonrası tripsinin hücre içinde de yıkıma sebep olmaması için besi ortamı (DMEM) eklendi. Sonrasında hücreler başka bir flaska alınıp üzerine yeterli miktarda besiyeri eklendi. Böylece hücreler sonraki denemelerde kullanılmak üzere inkübatöre kaldırıldı.
Pasaj malzemeleri |
Besi yerinin hücre kültüründen ayrımı |
PBS tamponu ile hücrelerin yıkanması |
HÜCRE KÜLTÜRÜ LABORATUVARINDA BİR GÜN-1
Kaydol:
Kayıtlar (Atom)